Τα δίδακτρα του ΠΜΣ «Καινοτόμος και Αειφόρος Επιχειρηματικότητα» ανέρχονται σε 3.900 ευρώ.
Το ΠΜΣ δύναται να παρέχει έναν αριθμό υποτροφιών βάσει ακαδημαϊκών κριτηρίων σε φοιτητές και φοιτήτριες πλήρους φοίτησης, σύμφωνα με απόφαση της Σ.Τ., στην οποία καθορίζεται, το ύψος των υποτροφιών, τα δικαιολογητικά, τα κριτήρια αξιολόγησης, η διαδικασία χορήγησης υποτροφιών, οι υποχρεώσεις και τα δικαιώματα των υποτρόφων. Οι υποτροφίες εγγράφονται στον εγκεκριμένο προϋπολογισμό του ΠΜΣ.
Το ΠΜΣ δύναται επίσης σε έκτακτες περιπτώσεις να χορηγεί βραβεία σε φοιτητές και φοιτήτριες με εξαιρετικές επιδόσεις, σύμφωνα με κριτήρια και διαδικασία που θα προβλέπεται με απόφαση της Συντονιστικής Επιτροπής (π.χ. στους ΜΦ, με το μεγαλύτερο μέσο όρο στη βαθμολογία του συνόλου των μαθημάτων του 1ου εξαμήνου ή προσφορά υπηρεσιών).
Υποτροφία δεν χορηγείται στην περίπτωση που οι ΜΦ λαμβάνουν ήδη υποτροφία από άλλη πηγή και σε ΜΦ που έχουν εισαχθεί στο ΠΜΣ χωρίς την υποχρέωση καταβολής τελών φοίτησης καθώς και στην περίπτωση που οι ΜΦ εργάζονται. Ειδικότερα, το ΠΜΣ παρέχει (χρηματικό́) βραβείο αριστείας σε 2 ΜΦ βάσει των επιδόσεών τους στα μαθήματα του 1ο εξαμήνου φοίτησης. Το ύψος του χρηματικού βραβείου καθορίζεται από τη Σ.Ε και ανέρχεται στο χρηματικό ποσό των 250,00 ευρώ ανά αριστούχο ΜΦ.
Επίσης παρέχει 1 χρηματικό βραβείο και βεβαίωση αριστείας στον μεταπτυχιακό φοιτητή με την καλύτερη επίδοση στο ΠΜΣ τον Σεπτέμβριο του επόμενου ακαδημαϊκού έτους. Το ύψος του χρηματικού βραβείου καθορίζεται από τη Σ.Ε και ανέρχεται στο χρηματικό ποσό των 500,00 ευρώ.
Τέλος το ΠΜΣ παρέχει βραβείο σε ΜΦ των οποίων οι εργασίες δημοσιεύονται σε έγκριτα περιοδικά της Οικονομικής Επιστήμης.